هو الجهاز المسؤول المؤلف من خلايا و أعضاء مختصة لحماية العضوية من التأثيرات الخارجية . (بالرغم من ان كل عضو تشريحي له بنيته الدفاعية من الأمراض الخمجية الخارجية كالبشرة في حالة الجلد ، و الطبقة المخاطية في حالة المعدة.).عندما يبدأ الجهاز المناعي يعمل بشكل مناسب ، يكون قادرا على حماية الجسم ضد الأخماج الجرثومية و الفيروسية و الأجسام الغريبة ، مدمرا الخلايا السرطانية و الأجسام الغريبة . إذا ضعف أداء الجهاز المناعي يزداد احتمال إصابة الجسم بالأمراض الخمجية و أنواع من السرطانات ، و تحدث الحالات الخمجية البسيطة مثل : نزلة البرد الشائع و الإنفلونزا .

- مناعة أصيلة Innate immunity :تتألف من مكونات موروثة تؤمن الخط الدفاعي الأول للمرضات التي تأتي مباشرة .
- مناعة مكتسبة Adaptive (acquired) immunity : عن طريق تصنيع الأضداد و الخلايا التائية T-cells المصممة خصيصا لاستهداف ممرضات محددة ، يطور الجسم مناعة متخصصة لكل نوع من انواع الممرضات . تأخذ هذه المناعة أياما قبل حدوثها لذلك فهي ليست مفيدة في بداية الخمج فالجسم يحتاج لفرصة اولى للتعرف على الممرض ، لكن الاستجابة في المرات اللاحقة من الخمج بنفس الممرض تكون سريعة .